蛍光顕微鏡は、免疫蛍光細胞化学の基本的なツールです。光源、フィルタープレートシステム、光学システム、その他の主要なコンポーネントで構成されています。通常の光学顕微鏡で観察します。スライド標本は通常、ヘマトキシリンエオシンで染色され、時には特別な染色で染色されます。
まず第一に、光学顕微鏡は、アーティファクト、変形、歪みを避けるために、生物学的材料の自然な状態を可能な限り維持する必要があるため、生物学的材料を固定する必要があります。光学顕微鏡の下で画像化する前に、フィルムは薄くて透明でなければなりません。材料を薄いスライスに切断したり、光を押したりしたり、他の手段で分散させたりすることに加えて、構造の詳細をよりよく観察するために、透明で染色するために他の方法を使用する必要があります。
実際、すべての生物学的材料は、パラフィンの埋め込み、スライス（または塗抹）、接着、ワックス溶解、透明性、その他のプロセスを介して、厚さと透明性の要件を満たす標本を取得し、染色手順を通じて一定のコントラストを得ることができます。
生物学的スライスは、26x76mmの標準サイズと1.1 ^ -1.3mmの厚さのガラススライドに貼り付けられていることがよくあります。ガラススライドの両側は平行平面でなければなりません。ガラススライドの厚さの要件はそれほど厳格ではありませんが、その厚さが補正度の高いコレクターの自由作動距離を超えると、ガラススライドの厚さが光源に焦点を合わせて、オブジェクトプレーンでフィールドストップ。この場合、0.9 ^ -1.0mmの厚さのガラススライドが適切です。