Mikroskop elektron memiliki tiga bagian, yaitu, laras lensa, perangkat vakum dan kabinet daya. Mikroskop optik terutama terdiri dari empat bagian, yaitu, lensa objektif, lensa mata, reflektor dan kondensor.
2. Prinsip pencitraan berbeda.
Mikroskop elektron menggunakan sinar elektron untuk menembus sampel, dan kemudian memperbesar gambar dengan lensa. Mikroskop optik terutama menggunakan prinsip pencitraan pembesar lensa cembung untuk memperbesar sampel.
3. Sumber iluminasi berbeda.
Sumber iluminasi yang digunakan oleh mikroskop elektron adalah aliran elektron yang dipancarkan oleh pistol elektron; Sumber iluminasi mikroskop optik adalah cahaya terlihat (sinar matahari atau cahaya). Karena panjang gelombang aliran elektron jauh lebih pendek daripada panjang gelombang gelombang cahaya, pembesaran dan resolusi mikroskop elektron secara signifikan lebih tinggi daripada mikroskop cahaya.
4. Lensa berbeda.
Lensa objektif untuk pembesar dalam mikroskop elektron adalah lensa elektromagnetik (kumparan elektromagnetik berbentuk cincin yang dapat menghasilkan medan magnet di bagian tengah); Lensa objektif mikroskop optik adalah lensa optik yang terbuat dari kaca. Ada tiga kelompok lensa elektromagnetik dalam mikroskop elektron, yang setara dengan lensa kondensor, lensa objektif dan lensa eyepiece di lensa optik.
5. Kegunaan yang berbeda
Karena resolusi yang tinggi, mikroskop elektron dapat digunakan untuk mengamati struktur material halus yang tidak dapat dibedakan dengan mikroskop biasa, dan juga dapat digunakan untuk membantu menganalisis komposisi material. Mikroskop optik terutama digunakan untuk pengamatan bahan mikroskopis dalam biologi dan kedokteran, dan sebagai alat eksperimental untuk siswa dalam pengajaran. 